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Diagnostiquer les maladies rares et améliorer le dépistage néonatal

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Les maladies rares désignent un ensemble hétérogène d'affections potentiellement mortelles, allant des maladies digestives aux maladies auto-immunes. En 2022, on recense environ 10 000 maladies rares distinctes, et 400 millions de personnes dans le monde sont touchées par une maladie rare.1 Le diagnostic des maladies rares est difficile, ce qui rend extrêmement complexe la mise en place de traitements adaptés en temps opportun. De nombreux patients atteints d'une maladie rare restent sans diagnostic pendant des années, et beaucoup meurent même sans avoir reçu de diagnostic précis.

Parmi les maladies rares, on trouve les troubles considérés comme des erreurs innées du métabolisme (EIM). Le dépistage néonatal (DNN) permet d'identifier les nourrissons atteints d'EIM qui, s'ils ne sont pas traités, pourraient présenter des complications cliniques graves, voire décéder. Les EIM sont des maladies génétiques rares qui provoquent des altérations ou des déficiences des enzymes impliquées dans le métabolisme. Bien que rares individuellement, les EIM surviennent chez environ 1 nouveau-né sur 2 500.2 Cependant, un patient peut présenter des signes cliniques qui ne correspondent pas à des maladies spécifiques, ou un panel de dépistage néonatal traditionnel peut ne fournir aucun indice.

Dans ces situations frustrantes, les chercheurs cliniques et les patients ont besoin de davantage de ressources vers lesquelles se tourner pour trouver des réponses. Metabolon une approche globale permettant d'identifier les maladies rares à travers plusieurs voies biochimiques en mesurant des centaines de métabolites dans un seul échantillon.

Les méthodes actuelles ne permettent pas d'identifier toutes les maladies rares

Environ 4 % de la population mondiale est touchée par une maladie rare, mais le nombre réel est probablement bien plus élevé, car les tests de dépistage actuels ne permettent de détecter que quelques maladies rares. De plus, l'identification de la cause spécifique d'une maladie rare peut prendre en moyenne sept ans.1Pendant cette période, les patients peuvent présenter des symptômes graves avant que le traitement le plus adapté à leur état ne soit identifié. De plus, comme de nombreuses IEM traitables ne sont pas incluses dans les panels standard du dépistage néonatal, les nouveau-nés présentant des symptômes d'une IEM pourraient tout de même nécessiter des examens complémentaires, même lorsque les résultats du dépistage néonatal traditionnel sont normaux.

Les techniques de diagnostic traditionnelles s'appuient sur plusieurs panels ciblés et de nombreux types d'échantillons pour réaliser une évaluation complète du patient et établir un diagnostic définitif pour un large éventail de maladies rares. Les méthodes actuelles de dépistage néonatal (NBS) comprennent généralement trois panels, qui ne ciblent que 43 à 49 troublesMalheureusement, ces multiples visites pour les tests et les consultations chez divers spécialistes entraînent des coûts élevés. 

Des analyses cliniques plus approfondies des échantillons prélevés sur les patients peuvent s'avérer essentielles pour identifier des signatures biomarqueurs, permettant ainsi aux cliniciens d'établir le bon diagnostic et de prescrire le traitement approprié. La métabolomique non ciblée permettrait de détecter plusieurs métabolites en un seul test afin de procéder à une analyse globale des perturbations métaboliques.

La métabolomique facilite l'identification des signatures et le diagnostic des maladies rares

La métabolomique permet d'identifier des biomarqueurs pour de nombreuses maladies rares, car elle permet d'analyser les profils métaboliques de chaque patient et d'établir un lien entre ces modifications et des mutations génétiques spécifiques. Cette technologie permet un diagnostic plus rapide des patients, ce qui leur permet de commencer un traitement plus tôt. Il existe des centaines de maladies IEM, et souvent, les manifestations cliniques de ces maladies sont vagues, ou la voie métabolique perturbée n'est pas immédiatement apparente. L'application de la métabolomique non ciblée, qui ne nécessite pas de connaissance préalable de la voie métabolique affectée, offre des avantages par rapport aux approches analytiques ciblées et peut étendre le potentiel diagnostique des dépistages IEM au-delà des 43 à 49 troubles actuellement évalués dans les programmes de dépistage néonatal (NBS). La technologie Metabolonoffre une couverture approfondie de multiples voies pouvant être altérées chez les patients atteints d’IEM ou d’autres maladies rares en fournissant une évaluation complète du métabolome. Plutôt que de cibler ces voies et ces enzymes à l’aide de tests individuels et de prélever de multiples échantillons, notre analyse métabolomique non ciblée élargit les informations mises à la disposition des cliniciens pour établir plus rapidement un diagnostic chez ces patients.

Par exemple, dans une étude récente publiée dans leJournal of the American Medical Association, la plateforme Metabolona été utilisée pour analyser plus de 2 400 échantillons provenant de patients chez lesquels on soupçonnait une maladie métabolique. La plateforme a correctement identifié des signatures biomarqueurs dans 128 cas et 70 pathologies métaboliques. 49 de ces maladies ne font pas l'objet de dépistage néonatal aux États-Unis. Plusieurs des maladies identifiées sont classées parmi les troubles neurométaboliques, pour lesquels le liquide céphalo-rachidien (LCR) est traditionnellement utilisé comme échantillon diagnostique. La technologie Metabolona permis d'identifier les signatures biomarqueurs de ces maladies dans le plasma, ce qui en fait une approche moins invasive pour les patients. Le taux de diagnostic de la plateforme a été multiplié par plusieurs par rapport aux diagnostics traditionnels.

Un nouvel espoir pour les patients atteints de maladies rares

La méthode de métabolomique clinique Metabolona été validée conformément aux réglementations et normes établies par les Clinical Laboratory Improvement Amendments (CLIA) et le College of American Pathologists (CAP). Notre plateforme de métabolomique non ciblée validée permet d’identifier jusqu’à 1 000 composés biochimiques dans le sang. Ces changements moléculaires revêtent donc une importance clinique, car ils constituent les premiers indicateurs de la progression de la maladie et de la réponse au traitement. L’application de notre expertise à la métabolomique clinique n’est qu’un exemple parmi d’autres de la manière dont Metabolon des informations biologiques invisibles aux autres technologies, en tirant parti de notre technologie exclusive. Nous sommes les seuls à pouvoir réaliser des tests de métabolomique par chromatographie liquide-spectrométrie de masse (LC-MS) dans un laboratoire certifié CLIA et accrédité CAP, et à fournir des résultats pertinents basés sur un grand nombre de métabolites mesurés dans un seul échantillon. L'extension des capacités métabolomiques au dépistage néonatal (NBS) recèle un énorme potentiel tant pour les chercheurs que pour les patients. Les signatures biochimiques identifiées grâce à notre technologie de métabolomique non ciblée fournissent des indicateurs et une voie plus claire vers le diagnostic clinique à l'aide d'un seul test de dépistage, alors que les méthodes diagnostiques traditionnelles nécessitent de multiples tests qui peuvent ne pas apporter de réponses.

Avertissement

Ce test a été mis au point et ses caractéristiques de performance ont été déterminées par Metabolon, Inc. Il n'a pas été autorisé ni approuvé par la Food and Drug Administration (FDA) des États-Unis. Metabolon soumis à la réglementation des Clinical Laboratory Improvement Amendments (CLIA) et du College of American Pathologists (CAP) en tant que laboratoire accrédité pour réaliser des analyses cliniques de haute complexité. Les résultats du test doivent être interprétés conjointement avec les autres données cliniques et de laboratoire dont dispose le clinicien.

Références

  1. Global Genes : Faits sur les maladies rares. 2022. https://globalgenes.org/rare-disease-facts/ 
  2. Lee KN, Uhlmann W, Hipp L, Quinonez SC. Le diagnostic des erreurs innées du métabolisme chez les adultes non diagnostiqués auparavant et orientés vers une évaluation en génétique médicale.Mol Genet Metab Rep. Déc. 2020 ; 25 : 100653. doi :10.1016/j.ymgmr.2020.100653 
  3. Liu N, Xiao J, Gijavanekar C, et al. Comparaison entre le profilage métabolomique non ciblé et le dépistage métabolique traditionnel pour identifier les erreurs innées du métabolisme.JAMA Netw Open. 1er juillet 2021 ; 4(7) : e2114155. doi:10.1001/jamanetworkopen.2021.14155 
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